通过容器和 Kubernetes 加快基因组测序

基因组序列是计算基因组中 DNA 核苷酸或碱基的顺序——构成生物体 DNA 的 A、C、G 和 T 的序列。人类基因组由超过 30 亿个基因字母组成,因此,基因组测序项目往往十分庞大,数据处理过程通常很复杂,需要各种工具和软件。传统基于 HPC 或 VM 的平台在基因组测序计算环境通常难以胜任。 X-Turing 是中国业界领先的生物技术公司,为企业和客户(例如,医生、科学家、营养师、审美学家等)提供与生物技术相关的解决方案和服务,通过使用容器和 Kubernetes 构建完整的工作流程和完整的堆栈工具链,克服了传统基于 HPC 和 VM 的平台在基因组测序环境中面临的种种挑战。X-Turing 的 Kubernetes 平台是生产中的实时系统,提供 5000 多个基于容器的应用程序和数千个容器实例,为企业客户提供服务,例如,北京基因组研究所、中国国家基因银行、新华人寿保险以及中国许多顶尖的医院和大学。 在本次演讲中,我们将讨论 X-Turing 在基因组测序项目中面临的挑战,以及他们如何利用现代技术,例如,容器和 Kubernetes,克服挑战。我们还将讨论 X-Turing IT 现代化发展的下一阶段,以便进一步提高 IT 效率,更好地满足业务需求。
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1.Anni Lai, Huawei; Chao Wang, X-Turing

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